近年来，菏泽市把发展新医药产业作为培育发展战略性新兴产业，推动工业转型升级的战略重点，以增强自主创新能力为着力点，以推进项目建设为突破口，加大新医药产业培育力度，取得明显成效。以步长制药、睿鹰制药、东明方明药业为龙头的新医药产业成为全市盈利水平最高、发展速度最快的行业，主要经济指标总量和增幅跨入全省医药行业前三。

　　2011年，全市规模以上医药工业企业达到89户,实现销售收入241亿元，占全市规模以上工业的7.1%，占全省医药工业的11.7 %，排全省第二位；同比增长44.71%，增幅排全省第二位；实现利税45亿元，占全市规模以上工业的9.8%，占全省医药工业的14.2%，排全省第二位；同比增长43.67%，排全省第一位；实现利润33亿元，占全市规模以上工业的11.3%，占全省医药工业的14.8%，排全省第一位；同比增长48.64%，排全省第二位。山东步长制药有限公司、菏泽睿鹰制药集团有限公司进入全国医药百强，按销售收入排名分别排第20位和34位，按利润总额排名分别排第四位和84位。

　　今年一季度，全市规模以上医药产业完成工业总产值59亿元，同比增长26.12%；实现主营业务收入57亿元，增长32.67%；实现利税11亿元，增长52.11%，实现利润8亿元，增长49.10%。